Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWF4

SLC52A1, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 1, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A1Q9NWF4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC52A1Q9NWF4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC52A1Q9NWF4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC52A1Q9NWF4 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC52A1Q9NWF4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms