Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms