Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms