Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms