Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VCPIP1Q96JH7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms