Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMD3Q96D46 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms