Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI8

TMC1, Transmembrane channel-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC1Q8TDI8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMC1Q8TDI8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMC1Q8TDI8 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMC1Q8TDI8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMC1Q8TDI8 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMC1Q8TDI8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMC1Q8TDI8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMC1Q8TDI8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMC1Q8TDI8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TMC1Q8TDI8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMC1Q8TDI8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMC1Q8TDI8 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMC1Q8TDI8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMC1Q8TDI8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC1Q8TDI8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms