Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD53Q8N9V6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms