Protein–RNA interactions for Protein: Q4G163

FBXO43, F-box only protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO43Q4G163 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms