Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.645e-7■□□□□ 8.9
PCBP1Q15365 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.255e-7■□□□□ 8.9
PCBP1Q15365 PTOV1-211ENST00000598632 1073 ntTSL 222.68■■□□□ 1.225e-7■□□□□ 8.9
PCBP1Q15365 PTOV1-203ENST00000594165 986 ntTSL 321.23■□□□□ 0.995e-7■□□□□ 8.9
PCBP1Q15365 PTOV1-217ENST00000601501 564 ntTSL 217.81■□□□□ 0.445e-7■□□□□ 8.9
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PCBP1Q15365 PTOV1-210ENST00000598325 1438 ntTSL 516.94■□□□□ 0.35e-7■□□□□ 8.9
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PCBP1Q15365 PTOV1-202ENST00000594151 995 ntTSL 515.61■□□□□ 0.095e-7■□□□□ 8.9
PCBP1Q15365 PTOV1-218ENST00000601612 1480 ntTSL 214.91□□□□□ -0.025e-7■□□□□ 8.9
PCBP1Q15365 MVD-209ENST00000565149 2352 ntTSL 1 (best)18.96■□□□□ 0.635e-7■□□□□ 8.9
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PCBP1Q15365 FN1-211ENST00000443816 7762 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.551e-61■□□□□ 8.9
PCBP1Q15365 FN1-207ENST00000421182 8103 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.551e-61■□□□□ 8.9
PCBP1Q15365 FN1-205ENST00000357867 7898 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.581e-61■□□□□ 8.9
PCBP1Q15365 FN1-203ENST00000354785 8905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.621e-61■□□□□ 8.9
PCBP1Q15365 FN1-209ENST00000432072 7759 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.771e-61■□□□□ 8.9
PCBP1Q15365 EIF6-208ENST00000462894 453 ntTSL 328.99■■■□□ 2.231e-6■□□□□ 8.9
PCBP1Q15365 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.581e-6■□□□□ 8.9
PCBP1Q15365 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.491e-6■□□□□ 8.9
PCBP1Q15365 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.411e-6■□□□□ 8.9
PCBP1Q15365 EIF6-207ENST00000456600 551 ntTSL 323.84■■□□□ 1.411e-6■□□□□ 8.9
PCBP1Q15365 EIF6-204ENST00000415116 739 ntTSL 523.19■■□□□ 1.31e-6■□□□□ 8.9
PCBP1Q15365 TKFC-202ENST00000524440 496 ntTSL 220.14■□□□□ 0.811e-6■□□□□ 8.9
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PCBP1Q15365 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.541e-6■□□□□ 8.9
PCBP1Q15365 EIF6-206ENST00000447927 932 ntTSL 1 (best)18.12■□□□□ 0.491e-6■□□□□ 8.9
PCBP1Q15365 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.381e-6■□□□□ 8.9
PCBP1Q15365 SNX5-214ENST00000490175 2025 ntTSL 1 (best)17.03■□□□□ 0.321e-6■□□□□ 8.9
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PCBP1Q15365 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.181e-6■□□□□ 8.9
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PCBP1Q15365 GREB1-201ENST00000234142 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.513e-10■□□□□ 8.9
PCBP1Q15365 PLEC-210ENST00000527096 13713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.561e-6■□□□□ 8.9
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PCBP1Q15365 TGFBR3-208ENST00000529608 785 ntTSL 59.42□□□□□ -0.91e-6■□□□□ 8.9
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PCBP1Q15365 SNX5-215ENST00000491090 819 ntTSL 35.2□□□□□ -1.581e-6■□□□□ 8.9
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PCBP1Q15365 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.051e-10■□□□□ 8.9
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PCBP1Q15365 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.651e-10■□□□□ 8.9
PCBP1Q15365 NUP214-223ENST00000530843 189 ntTSL 55.57□□□□□ -1.525e-21■□□□□ 8.9
PCBP1Q15365 SEPT9-214ENST00000586456 545 ntTSL 222.31■■□□□ 1.165e-6■□□□□ 8.9
PCBP1Q15365 HDLBP-215ENST00000427487 924 ntTSL 513.34□□□□□ -0.275e-6■□□□□ 8.9
PCBP1Q15365 HDLBP-237ENST00000479169 1017 ntTSL 212.23□□□□□ -0.455e-6■□□□□ 8.9
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PCBP1Q15365 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.155e-9■□□□□ 8.9
PCBP1Q15365 LTBP4-213ENST00000595529 814 ntTSL 516.49■□□□□ 0.237e-10■□□□□ 8.9
PCBP1Q15365 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.52■□□□□ 0.721e-71■□□□□ 8.8
PCBP1Q15365 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.14■□□□□ 0.651e-71■□□□□ 8.8
PCBP1Q15365 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.626e-8■□□□□ 8.8
PCBP1Q15365 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.216e-8■□□□□ 8.8
PCBP1Q15365 PDIA6-204ENST00000404824 2236 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.356e-8■□□□□ 8.8
PCBP1Q15365 PDIA6-208ENST00000617249 2344 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.476e-8■□□□□ 8.8
PCBP1Q15365 PDIA6-202ENST00000381611 2534 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.766e-8■□□□□ 8.8
PCBP1Q15365 PDIA6-203ENST00000404371 2682 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.766e-8■□□□□ 8.8
PCBP1Q15365 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.37e-8■□□□□ 8.8
PCBP1Q15365 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.867e-8■□□□□ 8.8
PCBP1Q15365 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.747e-8■□□□□ 8.8
PCBP1Q15365 DHRS2-208ENST00000556729 5318 ntTSL 216.6■□□□□ 0.257e-8■□□□□ 8.8
PCBP1Q15365 DHRS2-207ENST00000556701 3157 ntTSL 1 (best)14.95□□□□□ -0.027e-8■□□□□ 8.8
PCBP1Q15365 MAN2A2-212ENST00000559341 623 ntTSL 214.82□□□□□ -0.043e-6■□□□□ 8.8
PCBP1Q15365 MAN2A2-203ENST00000557990 956 ntTSL 514.69□□□□□ -0.063e-6■□□□□ 8.8
PCBP1Q15365 MAN2A2-230ENST00000561448 1443 ntTSL 212.55□□□□□ -0.43e-6■□□□□ 8.8
PCBP1Q15365 MAN2A2-226ENST00000560926 569 ntTSL 410.15□□□□□ -0.783e-6■□□□□ 8.8
PCBP1Q15365 MAN2A2-208ENST00000558538 576 ntTSL 47.65□□□□□ -1.183e-6■□□□□ 8.8
PCBP1Q15365 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.878e-14■□□□□ 8.8
PCBP1Q15365 MDH2-208ENST00000492663 546 ntTSL 29.17□□□□□ -0.942e-6■□□□□ 8.8
PCBP1Q15365 A2M-202ENST00000404455 623 ntTSL 55.9□□□□□ -1.462e-52■□□□□ 8.8
PCBP1Q15365 A2M-209ENST00000539638 590 ntTSL 45.9□□□□□ -1.462e-52■□□□□ 8.8
PCBP1Q15365 A2M-204ENST00000467091 533 ntTSL 53.59□□□□□ -1.832e-52■□□□□ 8.8
PCBP1Q15365 A2M-208ENST00000497324 533 ntTSL 311.58□□□□□ -0.563e-52■□□□□ 8.8
PCBP1Q15365 SF3A1-202ENST00000411423 548 ntTSL 421.1■□□□□ 0.973e-6■□□□□ 8.8
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