Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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