Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC1Q13547 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
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