Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms