Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms