Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms