Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms