Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RIPK4P57078 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms