Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EMP1P54849 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
EMP1P54849 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EMP1P54849 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EMP1P54849 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EMP1P54849 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EMP1P54849 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EMP1P54849 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EMP1P54849 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EMP1P54849 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EMP1P54849 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EMP1P54849 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EMP1P54849 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EMP1P54849 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EMP1P54849 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EMP1P54849 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
EMP1P54849 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EMP1P54849 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EMP1P54849 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EMP1P54849 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EMP1P54849 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EMP1P54849 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EMP1P54849 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EMP1P54849 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EMP1P54849 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EMP1P54849 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
EMP1P54849 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
EMP1P54849 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
EMP1P54849 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EMP1P54849 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EMP1P54849 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EMP1P54849 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EMP1P54849 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EMP1P54849 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EMP1P54849 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EMP1P54849 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EMP1P54849 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EMP1P54849 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EMP1P54849 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EMP1P54849 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EMP1P54849 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EMP1P54849 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
EMP1P54849 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
EMP1P54849 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
EMP1P54849 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EMP1P54849 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EMP1P54849 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EMP1P54849 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EMP1P54849 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EMP1P54849 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EMP1P54849 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EMP1P54849 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EMP1P54849 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EMP1P54849 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.2 ms