Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms