Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HK3P52790 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HK3P52790 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HK3P52790 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HK3P52790 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HK3P52790 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HK3P52790 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HK3P52790 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HK3P52790 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HK3P52790 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HK3P52790 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HK3P52790 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HK3P52790 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HK3P52790 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HK3P52790 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HK3P52790 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HK3P52790 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HK3P52790 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HK3P52790 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HK3P52790 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HK3P52790 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HK3P52790 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HK3P52790 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HK3P52790 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HK3P52790 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HK3P52790 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HK3P52790 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HK3P52790 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HK3P52790 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HK3P52790 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HK3P52790 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HK3P52790 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HK3P52790 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HK3P52790 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HK3P52790 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HK3P52790 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HK3P52790 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HK3P52790 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HK3P52790 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HK3P52790 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HK3P52790 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HK3P52790 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HK3P52790 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HK3P52790 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HK3P52790 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HK3P52790 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HK3P52790 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HK3P52790 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HK3P52790 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HK3P52790 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HK3P52790 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HK3P52790 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HK3P52790 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HK3P52790 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HK3P52790 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HK3P52790 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HK3P52790 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HK3P52790 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HK3P52790 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HK3P52790 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HK3P52790 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HK3P52790 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HK3P52790 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HK3P52790 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HK3P52790 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HK3P52790 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HK3P52790 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HK3P52790 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HK3P52790 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HK3P52790 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HK3P52790 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HK3P52790 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HK3P52790 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HK3P52790 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HK3P52790 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HK3P52790 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HK3P52790 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HK3P52790 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HK3P52790 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HK3P52790 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HK3P52790 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HK3P52790 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HK3P52790 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HK3P52790 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HK3P52790 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HK3P52790 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HK3P52790 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HK3P52790 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HK3P52790 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HK3P52790 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HK3P52790 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HK3P52790 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HK3P52790 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HK3P52790 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HK3P52790 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HK3P52790 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HK3P52790 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HK3P52790 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HK3P52790 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HK3P52790 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms