Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFNP31947 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFNP31947 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFNP31947 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFNP31947 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFNP31947 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFNP31947 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFNP31947 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFNP31947 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFNP31947 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFNP31947 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFNP31947 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFNP31947 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFNP31947 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFNP31947 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFNP31947 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFNP31947 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFNP31947 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFNP31947 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFNP31947 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SFNP31947 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFNP31947 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SFNP31947 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFNP31947 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFNP31947 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFNP31947 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFNP31947 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFNP31947 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFNP31947 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFNP31947 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFNP31947 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFNP31947 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFNP31947 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFNP31947 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFNP31947 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFNP31947 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFNP31947 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFNP31947 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFNP31947 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFNP31947 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFNP31947 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFNP31947 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFNP31947 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFNP31947 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFNP31947 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SFNP31947 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFNP31947 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFNP31947 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFNP31947 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFNP31947 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFNP31947 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFNP31947 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFNP31947 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFNP31947 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFNP31947 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFNP31947 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFNP31947 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFNP31947 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFNP31947 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SFNP31947 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SFNP31947 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFNP31947 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFNP31947 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SFNP31947 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFNP31947 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFNP31947 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFNP31947 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SFNP31947 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFNP31947 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFNP31947 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFNP31947 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFNP31947 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFNP31947 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFNP31947 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFNP31947 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFNP31947 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFNP31947 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFNP31947 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFNP31947 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFNP31947 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFNP31947 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFNP31947 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFNP31947 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFNP31947 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFNP31947 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFNP31947 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SFNP31947 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFNP31947 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFNP31947 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFNP31947 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFNP31947 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFNP31947 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFNP31947 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFNP31947 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFNP31947 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFNP31947 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFNP31947 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFNP31947 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFNP31947 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFNP31947 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms