Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEBLO76041 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEBLO76041 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEBLO76041 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEBLO76041 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEBLO76041 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEBLO76041 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEBLO76041 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEBLO76041 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEBLO76041 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEBLO76041 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEBLO76041 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEBLO76041 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEBLO76041 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEBLO76041 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEBLO76041 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEBLO76041 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEBLO76041 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NEBLO76041 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEBLO76041 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEBLO76041 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEBLO76041 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEBLO76041 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NEBLO76041 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEBLO76041 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEBLO76041 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEBLO76041 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEBLO76041 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEBLO76041 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEBLO76041 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEBLO76041 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEBLO76041 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEBLO76041 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEBLO76041 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEBLO76041 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEBLO76041 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEBLO76041 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEBLO76041 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEBLO76041 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEBLO76041 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEBLO76041 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEBLO76041 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEBLO76041 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEBLO76041 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEBLO76041 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEBLO76041 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEBLO76041 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEBLO76041 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NEBLO76041 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NEBLO76041 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEBLO76041 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NEBLO76041 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NEBLO76041 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEBLO76041 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NEBLO76041 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEBLO76041 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEBLO76041 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEBLO76041 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEBLO76041 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEBLO76041 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEBLO76041 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEBLO76041 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEBLO76041 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEBLO76041 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEBLO76041 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEBLO76041 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEBLO76041 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEBLO76041 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEBLO76041 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NEBLO76041 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NEBLO76041 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NEBLO76041 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NEBLO76041 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NEBLO76041 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NEBLO76041 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NEBLO76041 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NEBLO76041 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NEBLO76041 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NEBLO76041 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEBLO76041 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEBLO76041 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEBLO76041 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEBLO76041 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEBLO76041 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEBLO76041 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEBLO76041 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEBLO76041 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEBLO76041 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEBLO76041 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEBLO76041 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEBLO76041 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEBLO76041 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEBLO76041 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NEBLO76041 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEBLO76041 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEBLO76041 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEBLO76041 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEBLO76041 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEBLO76041 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEBLO76041 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms