Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPLO60437 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPLO60437 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PPLO60437 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPLO60437 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPLO60437 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPLO60437 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPLO60437 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPLO60437 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPLO60437 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPLO60437 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPLO60437 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPLO60437 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPLO60437 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPLO60437 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPLO60437 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPLO60437 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPLO60437 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPLO60437 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPLO60437 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPLO60437 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPLO60437 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPLO60437 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PPLO60437 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPLO60437 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPLO60437 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PPLO60437 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PPLO60437 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPLO60437 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPLO60437 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPLO60437 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPLO60437 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPLO60437 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPLO60437 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPLO60437 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPLO60437 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPLO60437 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPLO60437 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPLO60437 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPLO60437 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPLO60437 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPLO60437 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPLO60437 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPLO60437 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPLO60437 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPLO60437 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPLO60437 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PPLO60437 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PPLO60437 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PPLO60437 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
PPLO60437 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
PPLO60437 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PPLO60437 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
PPLO60437 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PPLO60437 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PPLO60437 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PPLO60437 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PPLO60437 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPLO60437 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPLO60437 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPLO60437 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPLO60437 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPLO60437 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPLO60437 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPLO60437 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPLO60437 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPLO60437 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PPLO60437 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPLO60437 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PPLO60437 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPLO60437 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPLO60437 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPLO60437 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PPLO60437 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPLO60437 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PPLO60437 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPLO60437 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPLO60437 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPLO60437 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPLO60437 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPLO60437 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPLO60437 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPLO60437 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPLO60437 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPLO60437 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPLO60437 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPLO60437 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPLO60437 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPLO60437 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPLO60437 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPLO60437 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPLO60437 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPLO60437 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PPLO60437 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPLO60437 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPLO60437 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPLO60437 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPLO60437 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPLO60437 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPLO60437 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms