Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms