Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms