Protein–RNA interactions for Protein: A8MVA2

KRTAP9-6, Keratin-associated protein 9-6, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-6A8MVA2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP9-6A8MVA2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms