Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms