Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3GL2Q99962 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms