Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms