Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms