Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms