Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ96

CMTM1, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1Q8IZ96 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms