Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4F1

LRP10, Low-density lipoprotein receptor-related protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP10Q7Z4F1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP10Q7Z4F1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms