Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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