Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms