Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms