Protein–RNA interactions for Protein: Q56NI9

ESCO2, N-acetyltransferase ESCO2, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESCO2Q56NI9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESCO2Q56NI9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESCO2Q56NI9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESCO2Q56NI9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESCO2Q56NI9 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESCO2Q56NI9 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESCO2Q56NI9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESCO2Q56NI9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESCO2Q56NI9 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESCO2Q56NI9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESCO2Q56NI9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESCO2Q56NI9 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESCO2Q56NI9 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESCO2Q56NI9 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESCO2Q56NI9 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESCO2Q56NI9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESCO2Q56NI9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESCO2Q56NI9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESCO2Q56NI9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESCO2Q56NI9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESCO2Q56NI9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ESCO2Q56NI9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESCO2Q56NI9 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESCO2Q56NI9 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESCO2Q56NI9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESCO2Q56NI9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESCO2Q56NI9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESCO2Q56NI9 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESCO2Q56NI9 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESCO2Q56NI9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESCO2Q56NI9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESCO2Q56NI9 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESCO2Q56NI9 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESCO2Q56NI9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESCO2Q56NI9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESCO2Q56NI9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESCO2Q56NI9 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESCO2Q56NI9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ESCO2Q56NI9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESCO2Q56NI9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ESCO2Q56NI9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ESCO2Q56NI9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ESCO2Q56NI9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ESCO2Q56NI9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ESCO2Q56NI9 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms