Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SGCAQ16586 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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SGCAQ16586 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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SGCAQ16586 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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SGCAQ16586 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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SGCAQ16586 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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SGCAQ16586 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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SGCAQ16586 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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SGCAQ16586 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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SGCAQ16586 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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