Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP7Q16576 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms