Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CNGA3Q16281 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA3Q16281 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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