Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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