Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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