Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms