Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PICALMQ13492 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms