Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 RNF114-203ENST00000622999 2438 ntTSL 222.9■■□□□ 1.263e-8■■■□□ 16
PABPC4Q13310 PYCR1-209ENST00000579698 572 ntTSL 422.7■■□□□ 1.227e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 SYNGR2-205ENST00000589183 796 ntTSL 322.51■■□□□ 1.197e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 DDX50-205ENST00000483593 1067 ntTSL 321.93■■□□□ 1.17e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 PUF60-217ENST00000531951 973 ntTSL 321.89■■□□□ 1.097e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.69■■□□□ 1.065e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 KHSRP-211ENST00000599642 428 ntTSL 221.64■■□□□ 1.052e-10■■■□□ 16
PABPC4Q13310 EMD-206ENST00000485261 792 ntTSL 320.9■□□□□ 0.942e-10■■■□□ 16
PABPC4Q13310 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.931e-11■■■□□ 16
PABPC4Q13310 DPY30-204ENST00000422413 601 ntTSL 320.84■□□□□ 0.931e-11■■■□□ 16
PABPC4Q13310 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.925e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.917e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.917e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.917e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 PYCR1-214ENST00000585215 767 ntTSL 420.58■□□□□ 0.897e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.883e-8■■■□□ 16
PABPC4Q13310 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.877e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 PUF60-214ENST00000529693 684 ntTSL 220.43■□□□□ 0.867e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.857e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 PYCR1-206ENST00000577624 510 ntTSL 320.37■□□□□ 0.857e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 PYCR1-210ENST00000581271 528 ntTSL 420.36■□□□□ 0.857e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.775e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 SYNGR2-208ENST00000591770 864 ntTSL 219.78■□□□□ 0.767e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.697e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 PTPA-209ENST00000414331 681 ntTSL 319.16■□□□□ 0.663e-8■■■□□ 16
PABPC4Q13310 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.655e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.635e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 ZNF767P-204ENST00000486492 1616 ntTSL 218.6■□□□□ 0.572e-9■■■□□ 16
PABPC4Q13310 PUF60-205ENST00000524570 1934 ntTSL 218.51■□□□□ 0.557e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 PUF60-207ENST00000526459 1003 ntTSL 218.2■□□□□ 0.57e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 PUF60-212ENST00000528320 922 ntTSL 218.2■□□□□ 0.57e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 PYCR1-205ENST00000405481 841 ntTSL 218.18■□□□□ 0.57e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 PYCR1-213ENST00000584848 949 ntTSL 518.07■□□□□ 0.487e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.477e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 EMD-204ENST00000468294 501 ntTSL 217.95■□□□□ 0.462e-10■■■□□ 16
PABPC4Q13310 PUF60-221ENST00000533162 761 ntTSL 317.86■□□□□ 0.457e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.447e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.397e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 PTPA-222ENST00000445241 949 ntTSL 317.41■□□□□ 0.383e-8■■■□□ 16
PABPC4Q13310 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.381e-11■■■□□ 16
PABPC4Q13310 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.372e-9■■■□□ 16
PABPC4Q13310 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.367e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 PUF60-220ENST00000532884 819 ntTSL 517.28■□□□□ 0.367e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.347e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 PUF60-215ENST00000529999 867 ntTSL 316.96■□□□□ 0.317e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.35e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.277e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 PYCR1-211ENST00000582198 868 ntTSL 516.71■□□□□ 0.277e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 PYCR1-215ENST00000585244 578 ntTSL 416.56■□□□□ 0.247e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.247e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.227e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 PUF60-211ENST00000527744 1007 ntTSL 216.08■□□□□ 0.167e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.167e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 DPY30-205ENST00000430665 524 ntTSL 516.03■□□□□ 0.161e-11■■■□□ 16
PABPC4Q13310 GLB1L2-202ENST00000529077 5621 ntTSL 1 (best)15.74■□□□□ 0.117e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.075e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.065e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 DPY30-203ENST00000414013 523 ntTSL 315.37■□□□□ 0.051e-11■■■□□ 16
PABPC4Q13310 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.047e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 TRAPPC1-206ENST00000573989 436 ntTSL 215.14■□□□□ 0.015e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 VRK1-204ENST00000555351 667 ntTSL 214.35□□□□□ -0.117e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 SUGT1-202ENST00000343788 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.127e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 GSK3A-204ENST00000493059 761 ntTSL 214.19□□□□□ -0.145e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 CLINT1-201ENST00000411809 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.147e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 CLINT1-210ENST00000530742 3344 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.217e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 PYCR1-208ENST00000579366 681 ntTSL 313.64□□□□□ -0.237e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 GYS1-202ENST00000323798 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.267e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 CLINT1-206ENST00000523094 3987 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.277e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 USP1-201ENST00000339950 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.283e-8■■■□□ 16
PABPC4Q13310 DPY30-207ENST00000452582 637 ntTSL 313.14□□□□□ -0.311e-11■■■□□ 16
PABPC4Q13310 RSBN1-206ENST00000616024 2703 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.355e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 RNF217-210ENST00000521654 11325 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.367e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 PRC1-201ENST00000361188 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.385e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 GUCD1-213ENST00000621833 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.457e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 GYS1-201ENST00000263276 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.467e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 BRD8-219ENST00000472478 745 ntTSL 312.2□□□□□ -0.468e-13■■■□□ 16
PABPC4Q13310 TRAPPC1-205ENST00000572656 409 ntTSL 212.17□□□□□ -0.465e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 PRC1-202ENST00000394249 3034 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.495e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 PUF60-213ENST00000528999 431 ntTSL 311.78□□□□□ -0.527e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 LINC01694-202ENST00000441095 6721 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.67e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 KIF18B-202ENST00000587309 4217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.617e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 RSBN1-203ENST00000476412 3772 ntTSL 211.09□□□□□ -0.635e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 PUF60-210ENST00000527584 547 ntTSL 210.74□□□□□ -0.697e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 SDCBP-212ENST00000523483 3589 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.75e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 HAUS4-208ENST00000553859 602 ntTSL 310.52□□□□□ -0.737e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 UHRF1BP1-201ENST00000192788 9570 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.777e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 ZNF767P-203ENST00000481762 357 ntTSL 310.02□□□□□ -0.812e-9■■■□□ 16
PABPC4Q13310 GUCD1-211ENST00000490922 567 ntTSL 39.84□□□□□ -0.837e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 FAXDC2-201ENST00000326080 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.857e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 FAXDC2-202ENST00000423554 3817 ntTSL 29.75□□□□□ -0.857e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.957e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.962e-9■■■□□ 16
PABPC4Q13310 BRD8-203ENST00000402931 2982 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.998e-13■■■□□ 16
PABPC4Q13310 BRD8-202ENST00000254900 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.018e-13■■■□□ 16
PABPC4Q13310 BRD8-201ENST00000230901 3198 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.078e-13■■■□□ 16
PABPC4Q13310 CHURC1-207ENST00000556089 571 ntTSL 28.25□□□□□ -1.097e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.113e-8■■■□□ 16
PABPC4Q13310 ZCCHC7-208ENST00000497924 699 ntTSL 28.05□□□□□ -1.127e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 BRD8-204ENST00000411594 2967 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.148e-13■■■□□ 16
PABPC4Q13310 BRD8-224ENST00000512140 2876 ntTSL 27.88□□□□□ -1.158e-13■■■□□ 16
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