Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
AP1B1Q10567 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms