Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms