Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGAEP38570 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGAEP38570 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms