Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PLNP26678 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PLNP26678 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PLNP26678 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PLNP26678 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PLNP26678 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PLNP26678 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PLNP26678 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PLNP26678 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PLNP26678 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PLNP26678 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PLNP26678 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PLNP26678 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PLNP26678 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PLNP26678 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PLNP26678 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PLNP26678 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PLNP26678 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PLNP26678 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PLNP26678 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PLNP26678 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PLNP26678 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PLNP26678 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PLNP26678 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PLNP26678 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PLNP26678 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PLNP26678 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PLNP26678 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PLNP26678 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PLNP26678 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PLNP26678 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PLNP26678 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PLNP26678 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PLNP26678 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PLNP26678 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PLNP26678 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PLNP26678 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PLNP26678 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PLNP26678 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PLNP26678 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PLNP26678 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PLNP26678 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
PLNP26678 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PLNP26678 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
PLNP26678 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PLNP26678 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PLNP26678 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PLNP26678 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PLNP26678 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PLNP26678 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PLNP26678 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms