Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR1P18146 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR1P18146 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR1P18146 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR1P18146 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR1P18146 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR1P18146 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR1P18146 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR1P18146 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR1P18146 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR1P18146 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR1P18146 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR1P18146 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR1P18146 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR1P18146 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR1P18146 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR1P18146 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR1P18146 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR1P18146 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms